Das Landesarchiv gliedert sich in folgende Archivbereiche:
Gemeinsames Archiv beider Appenzell (bis 1597)
| A |
Pergamenturkunden |
| B |
Papierurkunden & Papierakten |
| C |
Bücher |
Landesarchiv Appenzell Innerrhoden
| E |
Bücher 1561-2013 |
| F |
Altes Archiv I: Urkunden und Akten bis zur Landteilung 1597 |
| G |
Altes Archiv II: Urkunden und Akten 1597-1798 |
| H |
Helvetisches Archiv: Urkunden und Akten 1798-1803 |
| J |
Neues Archiv I: Urkunden und Akten 1803-1873 |
| K |
Neues Archiv II: Akten 1873 bis zirka 1970er-Jahre |
| L |
Privatarchive von Personen |
| M |
Privatarchive von Körperschaften, Vereinen & Unternehmen |
| N |
Neues Archiv III: Akten ab zirka 1970er-Jahre |
| O |
Bild- & Fotosammlung |
| P |
Plansammlung |
| Z |
Dokumentation |
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